Florian Willmitzer wurde in Wien geboren und wuchs im Süden der Stadt auf. Im Jahr 2001 schloss er sein Diplomstudium der Veterinärmedizin an der Veterinärmedizinischen Universität Wien erfolgreich ab. Nach dem Abschluss seines Grundwehrdienstes als Tierarzt und eines elfmonatigen Auslandseinsatzes startet er seine berufliche Karriere in einer grossen Klinik nördlich von Wien. Sein Schwerpunkt liegt dort auf der Bildgebenden Diagnostik. Im Jahr 2005 wechselte er ans Departement für Bildgebende Diagnostik der Veterinärmedizinischen Universität Wien, wo er 2007 seinen Doktortitel erwarb. Im Jahr 2012 wechselte er an die Klinik für Bildgebende Diagnostik der Vetsuisse-Fakultät der Universität Zürich, um dort eine Residency des European College of Veterinary Diagnostic Imaging (ECVDI) zu absolvieren und die Prüfung erfolgreich abzulegen. Ab 2017 ist er in Teilzeit in einer privaten Überweisungsklinik in der Nähe von Zürich tätig und betreut nebenberuflich Kliniken und Praxen teleradiologisch. Seit 2023 ist er in der Selbständigkeit tätig. Neben klassischen radiologischen Tätigkeiten als Belegarzt und in der Teleradiologie ist er auch GST-Strahlenschutzbeauftragter mit entsprechender Vortragstätigkeit, sowie im Vorstand des Vereins der Veterinärradiologie Schweiz (VVR-CH).